美国学者19 世纪末提出了肠- 脑概念，众多参与大脑功能调节的神经肽与递质相继在肠道中被发现，（ 如多巴胺、羟色胺、去甲肾上腺素等） 皆是由免疫、神经通路与内分泌途径共同构成的脑 - 肠轴通路， 在调控肠道功能与维持宿主健康方面发挥着重要作用。
近十年来的临床研究表明，肠道菌群参与调节宿主免疫及代谢等生理过程 ，同时在胃肠道与中枢神经系统双向应答中至关重要。微生物 - 胃肠 - 脑轴在神经系统疾病预防与治疗方面发挥着更精准的调节作用 。
胎0儿0分8娩后，外界微生物逐渐进入人体，其中胃肠道细菌的种类繁多、数目巨大，占机体微生物总量的 78%。人体肠道栖息着约 1014 个细菌，是人体细胞总数的 10 ～ 20 倍，每克大便的细菌数量达到 1012 个。
人体粪便的成分中 3/4 为水。l/4 为固体；人体肠道是一个巨大的细菌库，种类近 1000 种，其基因组总量是人的 100 倍之多，肠道菌群主要由 9 个门的细菌组成：厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门、梭杆菌门、Verrucomicrobia 菌门、蓝藻菌门、Spirochaeates 菌门、VadinBE97 菌门和一种古菌。
尽管人体肠道菌群种类超过上千种，其中 98% 的肠道菌可以归属为前四类，主要集中于厚壁菌门（64%）和拟杆菌门 (28%），变形菌门（8%）和放线菌门（3%）虽然也是肠道内的常见细菌，但数量相对较少。
自闭症障碍儿童多数具有肠胃问题，如消化不良，吸收不好，肠内病菌过度生长（真菌、细菌和病毒），以及异常的肠瘘。很多家长报告患儿有便秘、腹泻、胃肠道产生异常气体、打嗝、大便异味，有时交替出现胃肠道产生大量的异常气体、打嗝、大便异味等。
临床研究与动物实验的结果证实了肠道菌群 - 肠脑轴的存在，肠道菌群失调可能导致肠道炎症、胃肠道功能不适和生成较多的神经毒性代谢物，并引发许多肠 - 脑疾病，以及 ASD（自闭症）和阿尔茨海默症等 CNS 疾病。
肠道里的神经细胞在细胞类型、神经递质及感受器方面都与大脑极其相似, 与大脑的神经细胞数量相当, 比脊髓里的还多常见的 5-HT、多巴胺、谷氨酸、去甲肾上腺素、一氧化氮、阿片肽、P物质、促胃激素、促胰激素等神经递质和激素在大脑和肠神经系统都有广泛分布。因此, 肠道也被称为人的“第二脑”或“肠脑”。肠脑与头脑之间双向互通, 它们之间通过脑- 肠轴进行联接。 肠脑能够影响中枢神经系统, 进而影响人的情感, 认知和行为。
肠道菌群对正常的社交行为发育至关重要，对陌生个体的探究行为减少, 而一些重复的行为增加, 但当恢复肠道微生物后, 社交回避和重复行为得到了改善, 而社会认知障碍并没有变化。
北京泰和国医便是一家提供专业自闭症诊疗一站式服务的中西医结合医疗机构。以饮食干预，肠道菌群调整的方法为基础采用国际前沿的治疗和技术，拥有数位自闭症看诊专家，倡导免疫、消化、中医扶正、营养等多种方式，旨在实施更加有效的孤独症解决方案。
自闭症儿童表现出类似的社交和沟通障碍以及重复的行为, 并且男孩发病的比例远高于女孩, 因此, 自闭症可能正是由于肠道菌群的改变导致的。
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